Charakteristisch ist wie bei den meisten Farnen ein kriechendes Rhizom mit dunklen, nahezu schwarzbraunen Wurzeln, die auch zu der Bezeichnung "Schwarzwurzelfarn" geführt haben. Das Rhizom wird auf Stein, Ton oder Holz aufgebunden, wo sich die Wurzeln nach einiger Zeit fest anheften. Bei gut ausgebildetem Wurzelwerk gedeiht Microsorum pteropus auch direkt auf dem Substrat, sofern dessen Beschaffenheit nicht zu fein ist. Zu diesem Zweck wird das Rhizom auf dem Bodengrund fixiert, die Wurzeln suchen im Kies festen Halt.
An den Standort stellt Microsorum pteropus keine Ansprüche, dieser kann ganz nach optischen Aspekten gewählt werden. Der Javafarn kommt mit schlechten Lichtverhältnissen ebenso zurecht wie mit guter Beleuchtung und benötigt keine gesonderte Nährstoff- oder CO2-Zufuhr. Die Kultur ist in unbeheizten Becken und in tropischen Aquarien möglich, das Wasser kann weich bis hart sein. Lediglich eine leichte Strömung wirkt sich vorteilhaft auf das Wachstum aus. Bei viel Lichteinfall sollten sich schnell wachsende Pflanzen im Aquarium befinden, um den Javafarn vor Veralgung zu schützen. Mit einer maximalen Wuchshöhe von 40cm kommt sie am besten im Mittel- oder Hintergrund zur Geltung.
